十六世纪末,卫拉特蒙古逐渐崛起,他们游牧于天山以北的塔尔也哈台地区,伊犁河谷和额尔齐斯河两岸的广大草原,完全服属于清朝,向清朝纳贡。十七世纪初,它的势力已经越过伊犁河下游及以西地区广大哈萨克游牧草原,达到会中亚塔拉河流域,繁衍生息于这块土地上的塔塔尔人以游牧射猎为主,为卫拉特的属民。
十六世纪末与十七世纪初,当卫拉特人遭到沙俄侵略时,塔塔尔人也遭到战争的灾难。1589沙俄侵占塔拉河流域,建立了侵略据点。此后,塔拉河地区的一些塔塔尔人就逃到准噶尔部的辖区-阿尔泰山以东的科布多南北和额尔齐斯河上游到准噶尔盆地一带。1775年2月,清朝平复了额尔齐斯河上游到准噶尔封建贵族的叛乱后,收复了阿尔泰山以东的地区,居住在这儿的塔塔尔牧民和哈萨克大玉兹、中玉兹部落仍是清朝臣民。