宋庆历四年(1044年),区希反范率领本县毛南族、壮族群众,联合贵州省荔波县蒙赶带领的农民起义队伍举行起义,攻破环州(今环江毛南族自治县县城),给宋王朝在本地的统治势力以沉重打击。
万历二十六年(1598年),明王朝开始对毛南族征调田赋和徭役,将其编入王朝的“户籍”之内。
清咸丰末年,爆发了太平天国革命,许多毛南族青年投奔了石达开率领的太平军。
抗日战争时期,毛南族组成两支抗日队伍,多次占领思恩县城和临近乡村,与日寇交火,阻止他们闯入本地区烧杀掳掠。
1986年,根据毛南族人民的意愿和要求,经国务院批准,撤消环江县,设立环江毛南族自治县。