明清时期是畲族大量迁往汉族地区和形成目前的"大分散,小聚居分布格局的重要历史时段,史书和地方志中关于畲民的记载也大都体现在这一时期。这个时期畲族地区的社会经济生活相对比较安定,畲族的迁移基本上不带军事性质,而主要是基于畲族山地游耕的传统。这种迁徙的速度缓慢,迁徙的方式以家庭或家族中若干成员为单位徐徐而行,迁徙的取向是相对地旷人稀的汉族地区。概而言之,福建畲族多迁至广东,浙江,江西畲族多迁至福建,安徽畲族多迁至浙江,湖南,贵州畲族多迁至江西。
明清时期,畲区的封建社会已经确立,其社会经济状况和当地汉族基本一致。这个时期的畲族经过长期的动荡和迁徙以后,已基本稳定在闽,浙,粤,赣,皖等省的广大山区,对闽东,浙南山区的开发,做出了重要贡献。当畲族迁到闽东,浙南时,自然条件较好的平坝地方已多为汉人开垦,畲民只能在自然条件较差的地方,开山劈岭,建造田园。凡山谷冈麓地带,"皆治为陇亩",有水源之处开为梯田,仰赖天雨的山地,辟为旱田。地方史志记载,浙西南景宁,云和的土地就多为畲民所开垦。